上海市肿瘤研究所科学研究公共平台是基于共享、公用机制的科学研究技术支撑平台，在做好大型仪器设备的运行维护和对外服务的基础上，以科学研究方法学 的探索创新和关键仪器设备的自主创新研制为平台建设更高层次的目标。力争对提高科研水平、促进学科交叉和融合、加强高层次创新人才的培养起到至关重要的作用。研究平台目前拥有以主管科研副所长领衔、以生物学/医学博士、硕士为主的技术支持队伍，专职技术支撑人员达到11人。

        科学研究公共平台由基因组学分析亚平台、蛋白组学分析亚平台、代谢组学分析亚平台、光学成像分析亚平台、细胞分析亚平台、分子生物学亚平台、纳米技术研究亚平台七个亚平台组成，拥有定性/定量AB Sciex 5600/6500质谱系统、Thermo Ion Proton二代测序系统、Beckman MoFlo XDP/ Astrios流式分选平台、小动物活体成像/活体计算机断层扫描系统、蛋白质相互作用分析系统（Akata蛋白质纯化、Biacore蛋白质相互作用、全自动Wes蛋白质印迹系统），影像学分析平台（荧光显微镜、单光子共聚焦显微镜及双光子共聚焦显微镜）等六十余套大型仪器设备以及符合国家标准的免疫缺陷实验动物中心等大型设施，这些仪器设备同时加入了上海市研发公共服务平台。随着研究所对平台建设的持续投入，平台设备总投资已经达到1亿元；上海市肿瘤研究所科学研究公共平台的建立，设备配套水平和关键技术创新能力将会有一个更大幅度的提高。